Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP3Q15836 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP3Q15836 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP3Q15836 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP3Q15836 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP3Q15836 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP3Q15836 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAMP3Q15836 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAMP3Q15836 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAMP3Q15836 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP3Q15836 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP3Q15836 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP3Q15836 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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