Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TWIST1Q15672 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWIST1Q15672 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWIST1Q15672 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWIST1Q15672 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TWIST1Q15672 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TWIST1Q15672 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TWIST1Q15672 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWIST1Q15672 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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TWIST1Q15672 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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TWIST1Q15672 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TWIST1Q15672 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWIST1Q15672 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TWIST1Q15672 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TWIST1Q15672 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TWIST1Q15672 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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