Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDK3Q15120 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK3Q15120 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK3Q15120 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK3Q15120 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDK3Q15120 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK3Q15120 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK3Q15120 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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