Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHD4Q14839 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHD4Q14839 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHD4Q14839 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHD4Q14839 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHD4Q14839 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CHD4Q14839 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHD4Q14839 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHD4Q14839 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHD4Q14839 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHD4Q14839 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CHD4Q14839 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CHD4Q14839 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CHD4Q14839 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHD4Q14839 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHD4Q14839 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHD4Q14839 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHD4Q14839 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHD4Q14839 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHD4Q14839 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHD4Q14839 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHD4Q14839 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHD4Q14839 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHD4Q14839 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHD4Q14839 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHD4Q14839 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHD4Q14839 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHD4Q14839 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHD4Q14839 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHD4Q14839 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CHD4Q14839 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHD4Q14839 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CHD4Q14839 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHD4Q14839 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHD4Q14839 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHD4Q14839 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHD4Q14839 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHD4Q14839 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHD4Q14839 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
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