Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 RFC1YOR217W 2586 nt7.74□□□□□ -1.17
PKR1Q03880 PSD1YNL169C 1503 nt7.73□□□□□ -1.17
PKR1Q03880 HXK1YFR053C 1458 nt7.73□□□□□ -1.17
PKR1Q03880 ARP6YLR085C 1317 nt7.73□□□□□ -1.17
PKR1Q03880 TOK1YJL093C 2076 nt7.72□□□□□ -1.17
PKR1Q03880 AHT1YHR093W 549 nt7.72□□□□□ -1.17
PKR1Q03880 SWC5YBR231C 912 nt7.71□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 ZAP1YJL056C 2643 nt7.71□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 ALD5YER073W 1563 nt7.71□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 NRT1YOR071C 1797 nt7.7□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 PTH1YHR189W 573 nt7.7□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 GOR1YNL274C 1053 nt7.69□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 OPI10YOL032W 741 nt7.69□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 ALG3YBL082C 1377 nt7.68□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 RSC4YKR008W 1878 nt7.68□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 ARO8YGL202W 1503 nt7.68□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 SGA1YIL099W 1650 nt7.67□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 YPR064WYPR064W 420 nt7.67□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 AVT6YER119C 1347 nt7.67□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 YHR218WYHR218W 1812 nt7.66□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 DMA2YNL116W 1569 nt7.65□□□□□ -1.18
PKR1Q03880 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.64□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 YKL030WYKL030W 606 nt7.64□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 UTR1YJR049C 1593 nt7.63□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 KES1YPL145C 1305 nt7.62□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 RSC8YFR037C 1674 nt7.62□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 CYT1YOR065W 930 nt7.61□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 TAD3YLR316C 969 nt7.59□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 LSB6YJL100W 1824 nt7.59□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 YRF1-2YER190W 5046 nt7.59□□□□□ -1.19
PKR1Q03880 NBP35YGL091C 987 nt7.57□□□□□ -1.2
PKR1Q03880 MTO1YGL236C 2010 nt7.57□□□□□ -1.2
PKR1Q03880 PCP1YGR101W 1041 nt7.56□□□□□ -1.2
PKR1Q03880 CCT2YIL142W 1584 nt7.55□□□□□ -1.2
PKR1Q03880 MEP3YPR138C 1470 nt7.55□□□□□ -1.2
PKR1Q03880 DAT1YML113W 747 nt7.54□□□□□ -1.2
PKR1Q03880 SPP1YPL138C 1062 nt7.54□□□□□ -1.2
PKR1Q03880 DBP1YPL119C 1854 nt7.53□□□□□ -1.2
PKR1Q03880 ODC1YPL134C 933 nt7.52□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 YLR415CYLR415C 339 nt7.51□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 SAM35YHR083W 990 nt7.5□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 TIM17YJL143W 477 nt7.5□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 SHM2YLR058C 1410 nt7.5□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 TOM71YHR117W 1920 nt7.49□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 MCM5YLR274W 2328 nt7.49□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 NSG2YNL156C 900 nt7.49□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 TPN1YGL186C 1740 nt7.49□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 SHY1YGR112W 1170 nt7.48□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 RBG1YAL036C 1110 nt7.48□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 MDL2YPL270W 2322 nt7.48□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 SSL2YIL143C 2532 nt7.48□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 FRA1YLL029W 2250 nt7.47□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 YCR102CYCR102C 1107 nt7.47□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 BDH1YAL060W 1149 nt7.47□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 YOR072WYOR072W 315 nt7.47□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 BET2YPR176C 978 nt7.47□□□□□ -1.21
PKR1Q03880 HXT1YHR094C 1713 nt7.43□□□□□ -1.22
PKR1Q03880 GAP1YKR039W 1809 nt7.43□□□□□ -1.22
PKR1Q03880 MAS1YLR163C 1389 nt7.42□□□□□ -1.22
PKR1Q03880 HXT10YFL011W 1641 nt7.41□□□□□ -1.22
PKR1Q03880 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.4□□□□□ -1.22
PKR1Q03880 NIT1YIL164C 600 nt7.4□□□□□ -1.22
PKR1Q03880 MEX67YPL169C 1800 nt7.39□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 NBA1YOL070C 1506 nt7.39□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 MDM35YKL053C-A 261 nt7.39□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 ZTA1YBR046C 1005 nt7.39□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 CWC15YDR163W 528 nt7.38□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 LSC2YGR244C 1284 nt7.38□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 ALR1YOL130W 2580 nt7.38□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 MRP20YDR405W 792 nt7.37□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 URA6YKL024C 615 nt7.37□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 YSP3YOR003W 1437 nt7.36□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 UFO1YML088W 2007 nt7.35□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 ACH1YBL015W 1581 nt7.34□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 DAK2YFL053W 1776 nt7.34□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 CWP2YKL096W-A 279 nt7.34□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 SGT2YOR007C 1041 nt7.34□□□□□ -1.23
PKR1Q03880 QDR2YIL121W 1629 nt7.34□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 YBL086CYBL086C 1401 nt7.33□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 MRS6YOR370C 1812 nt7.32□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 TIR3YIL011W 810 nt7.32□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 GID8YMR135C 1368 nt7.32□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 AGP3YFL055W 1677 nt7.32□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 DIF1YLR437C 402 nt7.31□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 RTG2YGL252C 1767 nt7.3□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 FIT1YDR534C 1587 nt7.29□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 SFL1YOR140W 2301 nt7.29□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 LPD1YFL018C 1500 nt7.29□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.28□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 YLR173WYLR173W 1827 nt7.28□□□□□ -1.24
PKR1Q03880 RET2YFR051C 1641 nt7.27□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 UFD1YGR048W 1086 nt7.27□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 SHB17YKR043C 816 nt7.27□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 RTG1YOL067C 534 nt7.27□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 DIG1YPL049C 1359 nt7.26□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 PHO23YNL097C 993 nt7.26□□□□□ -1.25
PKR1Q03880 VPS75YNL246W 795 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms