Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ID3Q02535 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ID3Q02535 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ID3Q02535 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ID3Q02535 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ID3Q02535 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ID3Q02535 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ID3Q02535 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ID3Q02535 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ID3Q02535 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ID3Q02535 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ID3Q02535 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ID3Q02535 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ID3Q02535 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ID3Q02535 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ID3Q02535 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ID3Q02535 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ID3Q02535 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ID3Q02535 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ID3Q02535 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ID3Q02535 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ID3Q02535 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ID3Q02535 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ID3Q02535 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ID3Q02535 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ID3Q02535 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ID3Q02535 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ID3Q02535 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ID3Q02535 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ID3Q02535 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ID3Q02535 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ID3Q02535 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ID3Q02535 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ID3Q02535 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ID3Q02535 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ID3Q02535 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ID3Q02535 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ID3Q02535 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ID3Q02535 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ID3Q02535 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ID3Q02535 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ID3Q02535 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ID3Q02535 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ID3Q02535 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ID3Q02535 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ID3Q02535 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ID3Q02535 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ID3Q02535 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ID3Q02535 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ID3Q02535 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ID3Q02535 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ID3Q02535 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ID3Q02535 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ID3Q02535 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ID3Q02535 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ID3Q02535 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ID3Q02535 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ID3Q02535 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ID3Q02535 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ID3Q02535 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ID3Q02535 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ID3Q02535 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ID3Q02535 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ID3Q02535 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ID3Q02535 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ID3Q02535 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ID3Q02535 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ID3Q02535 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ID3Q02535 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ID3Q02535 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ID3Q02535 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ID3Q02535 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ID3Q02535 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ID3Q02535 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ID3Q02535 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ID3Q02535 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ID3Q02535 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ID3Q02535 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ID3Q02535 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ID3Q02535 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ID3Q02535 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ID3Q02535 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ID3Q02535 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ID3Q02535 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ID3Q02535 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ID3Q02535 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ID3Q02535 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ID3Q02535 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ID3Q02535 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ID3Q02535 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ID3Q02535 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ID3Q02535 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ID3Q02535 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ID3Q02535 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ID3Q02535 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ID3Q02535 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ID3Q02535 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ID3Q02535 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ID3Q02535 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ID3Q02535 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms