Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PLCB2Q00722 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLCB2Q00722 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLCB2Q00722 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLCB2Q00722 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLCB2Q00722 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLCB2Q00722 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PLCB2Q00722 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLCB2Q00722 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PLCB2Q00722 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PLCB2Q00722 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PLCB2Q00722 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PLCB2Q00722 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PLCB2Q00722 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PLCB2Q00722 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PLCB2Q00722 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PLCB2Q00722 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PLCB2Q00722 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PLCB2Q00722 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PLCB2Q00722 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLCB2Q00722 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLCB2Q00722 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PLCB2Q00722 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PLCB2Q00722 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms