Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX6-1P78426 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX6-1P78426 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX6-1P78426 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKX6-1P78426 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKX6-1P78426 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms