Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK2BP67870 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSNK2BP67870 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK2BP67870 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CSNK2BP67870 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK2BP67870 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSNK2BP67870 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSNK2BP67870 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK2BP67870 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms