Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUMO1P63165 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SUMO1P63165 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SUMO1P63165 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SUMO1P63165 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SUMO1P63165 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUMO1P63165 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SUMO1P63165 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SUMO1P63165 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SUMO1P63165 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms