Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUBP1P53384 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUBP1P53384 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUBP1P53384 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUBP1P53384 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUBP1P53384 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUBP1P53384 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUBP1P53384 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUBP1P53384 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUBP1P53384 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUBP1P53384 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUBP1P53384 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUBP1P53384 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUBP1P53384 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUBP1P53384 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUBP1P53384 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUBP1P53384 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUBP1P53384 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUBP1P53384 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUBP1P53384 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUBP1P53384 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUBP1P53384 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUBP1P53384 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUBP1P53384 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUBP1P53384 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUBP1P53384 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUBP1P53384 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUBP1P53384 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUBP1P53384 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUBP1P53384 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUBP1P53384 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUBP1P53384 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUBP1P53384 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NUBP1P53384 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUBP1P53384 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUBP1P53384 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUBP1P53384 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUBP1P53384 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUBP1P53384 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms