Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX3P48380 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX3P48380 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX3P48380 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX3P48380 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX3P48380 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX3P48380 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFX3P48380 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFX3P48380 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX3P48380 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX3P48380 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX3P48380 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX3P48380 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX3P48380 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX3P48380 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX3P48380 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX3P48380 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX3P48380 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX3P48380 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX3P48380 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX3P48380 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX3P48380 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX3P48380 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX3P48380 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX3P48380 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX3P48380 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX3P48380 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX3P48380 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX3P48380 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX3P48380 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX3P48380 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX3P48380 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX3P48380 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX3P48380 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX3P48380 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX3P48380 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX3P48380 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX3P48380 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX3P48380 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX3P48380 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX3P48380 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX3P48380 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX3P48380 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX3P48380 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX3P48380 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX3P48380 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX3P48380 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX3P48380 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX3P48380 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX3P48380 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX3P48380 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX3P48380 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX3P48380 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX3P48380 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RFX3P48380 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX3P48380 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX3P48380 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX3P48380 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX3P48380 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX3P48380 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX3P48380 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX3P48380 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX3P48380 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX3P48380 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX3P48380 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX3P48380 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX3P48380 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX3P48380 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX3P48380 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX3P48380 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX3P48380 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX3P48380 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX3P48380 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX3P48380 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX3P48380 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX3P48380 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX3P48380 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX3P48380 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX3P48380 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX3P48380 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX3P48380 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX3P48380 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX3P48380 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX3P48380 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX3P48380 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX3P48380 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX3P48380 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX3P48380 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX3P48380 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX3P48380 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX3P48380 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX3P48380 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX3P48380 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX3P48380 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX3P48380 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX3P48380 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX3P48380 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX3P48380 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX3P48380 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX3P48380 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms