Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX19P40855 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX19P40855 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX19P40855 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX19P40855 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX19P40855 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX19P40855 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX19P40855 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX19P40855 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX19P40855 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX19P40855 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX19P40855 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PEX19P40855 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX19P40855 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX19P40855 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX19P40855 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX19P40855 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX19P40855 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX19P40855 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX19P40855 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX19P40855 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX19P40855 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX19P40855 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX19P40855 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX19P40855 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX19P40855 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX19P40855 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX19P40855 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX19P40855 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX19P40855 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX19P40855 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX19P40855 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX19P40855 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PEX19P40855 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX19P40855 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX19P40855 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX19P40855 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX19P40855 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX19P40855 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX19P40855 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX19P40855 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX19P40855 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX19P40855 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX19P40855 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX19P40855 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX19P40855 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX19P40855 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX19P40855 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX19P40855 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX19P40855 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX19P40855 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX19P40855 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX19P40855 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX19P40855 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PEX19P40855 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX19P40855 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX19P40855 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX19P40855 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX19P40855 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX19P40855 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX19P40855 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX19P40855 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX19P40855 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX19P40855 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX19P40855 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX19P40855 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX19P40855 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX19P40855 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX19P40855 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX19P40855 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX19P40855 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX19P40855 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX19P40855 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX19P40855 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX19P40855 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX19P40855 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX19P40855 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX19P40855 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX19P40855 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX19P40855 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX19P40855 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX19P40855 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX19P40855 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX19P40855 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX19P40855 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX19P40855 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX19P40855 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX19P40855 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX19P40855 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX19P40855 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX19P40855 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX19P40855 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX19P40855 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX19P40855 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX19P40855 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX19P40855 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX19P40855 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX19P40855 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX19P40855 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX19P40855 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms