Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTRLP40313 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTRLP40313 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTRLP40313 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTRLP40313 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTRLP40313 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTRLP40313 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTRLP40313 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTRLP40313 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTRLP40313 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTRLP40313 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTRLP40313 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTRLP40313 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTRLP40313 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTRLP40313 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTRLP40313 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTRLP40313 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTRLP40313 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTRLP40313 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTRLP40313 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTRLP40313 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTRLP40313 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTRLP40313 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTRLP40313 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTRLP40313 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTRLP40313 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTRLP40313 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTRLP40313 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTRLP40313 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTRLP40313 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTRLP40313 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTRLP40313 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTRLP40313 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTRLP40313 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTRLP40313 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTRLP40313 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTRLP40313 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTRLP40313 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTRLP40313 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTRLP40313 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTRLP40313 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTRLP40313 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTRLP40313 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTRLP40313 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTRLP40313 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTRLP40313 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTRLP40313 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTRLP40313 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTRLP40313 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTRLP40313 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTRLP40313 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTRLP40313 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTRLP40313 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTRLP40313 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTRLP40313 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTRLP40313 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTRLP40313 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTRLP40313 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTRLP40313 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTRLP40313 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTRLP40313 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTRLP40313 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTRLP40313 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTRLP40313 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTRLP40313 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTRLP40313 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTRLP40313 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTRLP40313 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTRLP40313 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTRLP40313 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTRLP40313 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTRLP40313 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTRLP40313 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTRLP40313 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTRLP40313 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTRLP40313 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTRLP40313 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTRLP40313 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTRLP40313 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTRLP40313 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTRLP40313 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTRLP40313 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTRLP40313 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTRLP40313 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTRLP40313 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTRLP40313 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTRLP40313 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTRLP40313 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTRLP40313 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTRLP40313 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTRLP40313 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTRLP40313 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTRLP40313 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTRLP40313 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTRLP40313 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTRLP40313 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTRLP40313 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTRLP40313 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTRLP40313 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTRLP40313 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms