Protein–RNA interactions for Protein: P38241

ECM2, Pre-mRNA-splicing factor SLT11, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM2P38241 SHH4YLR164W 507 nt10.44□□□□□ -0.74
ECM2P38241 THI74YDR438W 1113 nt10.43□□□□□ -0.74
ECM2P38241 LSC2YGR244C 1284 nt10.41□□□□□ -0.74
ECM2P38241 PRM5YIL117C 957 nt10.41□□□□□ -0.74
ECM2P38241 SHB17YKR043C 816 nt10.4□□□□□ -0.74
ECM2P38241 RPM1RPM1 483 nt10.4□□□□□ -0.74
ECM2P38241 YDR010CYDR010C 333 nt10.39□□□□□ -0.75
ECM2P38241 UTR1YJR049C 1593 nt10.37□□□□□ -0.75
ECM2P38241 HIF1YLL022C 1158 nt10.37□□□□□ -0.75
ECM2P38241 MSF1YPR047W 1410 nt10.37□□□□□ -0.75
ECM2P38241 GAP1YKR039W 1809 nt10.36□□□□□ -0.75
ECM2P38241 PRO1YDR300C 1287 nt10.36□□□□□ -0.75
ECM2P38241 UBA4YHR111W 1323 nt10.35□□□□□ -0.75
ECM2P38241 POM34YLR018C 900 nt10.35□□□□□ -0.75
ECM2P38241 ALD4YOR374W 1560 nt10.35□□□□□ -0.75
ECM2P38241 SFA1YDL168W 1161 nt10.33□□□□□ -0.76
ECM2P38241 YAT1YAR035W 2064 nt10.3□□□□□ -0.76
ECM2P38241 YSR3YKR053C 1215 nt10.3□□□□□ -0.76
ECM2P38241 RET2YFR051C 1641 nt10.29□□□□□ -0.76
ECM2P38241 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.29□□□□□ -0.76
ECM2P38241 PHO89YBR296C 1725 nt10.29□□□□□ -0.76
ECM2P38241 ATG15YCR068W 1563 nt10.27□□□□□ -0.76
ECM2P38241 YML089CYML089C 369 nt10.27□□□□□ -0.77
ECM2P38241 REG2YBR050C 1017 nt10.27□□□□□ -0.77
ECM2P38241 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.26□□□□□ -0.77
ECM2P38241 TOM6YOR045W 186 nt10.25□□□□□ -0.77
ECM2P38241 YGL034CYGL034C 366 nt10.24□□□□□ -0.77
ECM2P38241 SAM35YHR083W 990 nt10.23□□□□□ -0.77
ECM2P38241 XYL2YLR070C 1071 nt10.23□□□□□ -0.77
ECM2P38241 FRE6YLL051C 2139 nt10.22□□□□□ -0.77
ECM2P38241 YCR087WYCR087W 516 nt10.21□□□□□ -0.77
ECM2P38241 DIF1YLR437C 402 nt10.21□□□□□ -0.77
ECM2P38241 YJR154WYJR154W 1041 nt10.18□□□□□ -0.78
ECM2P38241 CMP2YML057W 1815 nt10.18□□□□□ -0.78
ECM2P38241 MRP20YDR405W 792 nt10.17□□□□□ -0.78
ECM2P38241 TIF6YPR016C 738 nt10.17□□□□□ -0.78
ECM2P38241 COQ2YNR041C 1119 nt10.16□□□□□ -0.78
ECM2P38241 NDI1YML120C 1542 nt10.16□□□□□ -0.78
ECM2P38241 PEX2YJL210W 816 nt10.15□□□□□ -0.78
ECM2P38241 HIP1YGR191W 1812 nt10.14□□□□□ -0.79
ECM2P38241 RBG1YAL036C 1110 nt10.13□□□□□ -0.79
ECM2P38241 ZRT3YKL175W 1512 nt10.12□□□□□ -0.79
ECM2P38241 DBP1YPL119C 1854 nt10.12□□□□□ -0.79
ECM2P38241 AIM45YPR004C 1035 nt10.11□□□□□ -0.79
ECM2P38241 RPC82YPR190C 1965 nt10.11□□□□□ -0.79
ECM2P38241 INA1YLR413W 2028 nt10.09□□□□□ -0.79
ECM2P38241 HXT1YHR094C 1713 nt10.08□□□□□ -0.8
ECM2P38241 SBA1YKL117W 651 nt10.08□□□□□ -0.8
ECM2P38241 SPT20YOL148C 1815 nt10.07□□□□□ -0.8
ECM2P38241 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.07□□□□□ -0.8
ECM2P38241 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.07□□□□□ -0.8
ECM2P38241 YAR028WYAR028W 705 nt10.06□□□□□ -0.8
ECM2P38241 MET28YIR017C 564 nt10.05□□□□□ -0.8
ECM2P38241 Q0010Q0010 387 nt10.05□□□□□ -0.8
ECM2P38241 RPL4BYDR012W 1089 nt10.04□□□□□ -0.8
ECM2P38241 YJL067WYJL067W 351 nt10.04□□□□□ -0.8
ECM2P38241 RPL4AYBR031W 1089 nt10.04□□□□□ -0.8
ECM2P38241 PAM17YKR065C 594 nt10.02□□□□□ -0.81
ECM2P38241 YBL086CYBL086C 1401 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 SHY1YGR112W 1170 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 YLR122CYLR122C 378 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 NRT1YOR071C 1797 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 MTG2YHR168W 1557 nt10.01□□□□□ -0.81
ECM2P38241 SED1YDR077W 1017 nt10□□□□□ -0.81
ECM2P38241 UTH1YKR042W 1098 nt10□□□□□ -0.81
ECM2P38241 LIP1YMR298W 453 nt9.99□□□□□ -0.81
ECM2P38241 ARA2YMR041C 1008 nt9.98□□□□□ -0.81
ECM2P38241 HSL7YBR133C 2484 nt9.98□□□□□ -0.81
ECM2P38241 GLR1YPL091W 1452 nt9.98□□□□□ -0.81
ECM2P38241 LCP5YER127W 1074 nt9.97□□□□□ -0.81
ECM2P38241 RPS14BYJL191W 417 nt9.97□□□□□ -0.81
ECM2P38241 ZTA1YBR046C 1005 nt9.96□□□□□ -0.82
ECM2P38241 AKR2YOR034C 2250 nt9.94□□□□□ -0.82
ECM2P38241 FIT3YOR383C 615 nt9.93□□□□□ -0.82
ECM2P38241 ALP1YNL270C 1722 nt9.92□□□□□ -0.82
ECM2P38241 LEU9YOR108W 1815 nt9.91□□□□□ -0.82
ECM2P38241 SDH5YOL071W 489 nt9.91□□□□□ -0.82
ECM2P38241 UFO1YML088W 2007 nt9.9□□□□□ -0.82
ECM2P38241 YPL251WYPL251W 303 nt9.9□□□□□ -0.82
ECM2P38241 URA6YKL024C 615 nt9.89□□□□□ -0.83
ECM2P38241 YMR244WYMR244W 1068 nt9.89□□□□□ -0.83
ECM2P38241 SAM1YLR180W 1149 nt9.88□□□□□ -0.83
ECM2P38241 BRR1YPR057W 1026 nt9.87□□□□□ -0.83
ECM2P38241 TSC10YBR265W 963 nt9.85□□□□□ -0.83
ECM2P38241 URH1YDR400W 1023 nt9.84□□□□□ -0.83
ECM2P38241 TOA2YKL058W 369 nt9.84□□□□□ -0.83
ECM2P38241 ABZ2YMR289W 1125 nt9.84□□□□□ -0.83
ECM2P38241 PAB1YER165W 1734 nt9.83□□□□□ -0.84
ECM2P38241 YLR111WYLR111W 333 nt9.83□□□□□ -0.84
ECM2P38241 OYE3YPL171C 1203 nt9.81□□□□□ -0.84
ECM2P38241 ILV3YJR016C 1758 nt9.8□□□□□ -0.84
ECM2P38241 YOR325WYOR325W 474 nt9.8□□□□□ -0.84
ECM2P38241 GND2YGR256W 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
ECM2P38241 YGR012WYGR012W 1182 nt9.79□□□□□ -0.84
ECM2P38241 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms