Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 STR3YGL184C 1398 nt9.15□□□□□ -0.94
SEF1P34228 YNR029CYNR029C 1290 nt9.15□□□□□ -0.94
SEF1P34228 FUR4YBR021W 1902 nt9.15□□□□□ -0.95
SEF1P34228 HEL2YDR266C 1920 nt9.14□□□□□ -0.95
SEF1P34228 NBP35YGL091C 987 nt9.14□□□□□ -0.95
SEF1P34228 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.13□□□□□ -0.95
SEF1P34228 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.13□□□□□ -0.95
SEF1P34228 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.13□□□□□ -0.95
SEF1P34228 YLR349WYLR349W 507 nt9.12□□□□□ -0.95
SEF1P34228 STE4YOR212W 1272 nt9.12□□□□□ -0.95
SEF1P34228 RPL4BYDR012W 1089 nt9.11□□□□□ -0.95
SEF1P34228 RPL4AYBR031W 1089 nt9.11□□□□□ -0.95
SEF1P34228 SHH4YLR164W 507 nt9.1□□□□□ -0.95
SEF1P34228 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.1□□□□□ -0.95
SEF1P34228 SDH5YOL071W 489 nt9.1□□□□□ -0.95
SEF1P34228 TIR3YIL011W 810 nt9.09□□□□□ -0.95
SEF1P34228 AQY2YLL052C 450 nt9.09□□□□□ -0.95
SEF1P34228 RAD23YEL037C 1197 nt9.08□□□□□ -0.96
SEF1P34228 RPS14BYJL191W 417 nt9.08□□□□□ -0.96
SEF1P34228 CAB5YDR196C 726 nt9.07□□□□□ -0.96
SEF1P34228 CLB6YGR109C 1143 nt9.04□□□□□ -0.96
SEF1P34228 AAC1YMR056C 930 nt9.04□□□□□ -0.96
SEF1P34228 LSC2YGR244C 1284 nt9.03□□□□□ -0.96
SEF1P34228 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.03□□□□□ -0.96
SEF1P34228 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.03□□□□□ -0.96
SEF1P34228 ADH7YCR105W 1086 nt9.02□□□□□ -0.97
SEF1P34228 TOM6YOR045W 186 nt9.02□□□□□ -0.97
SEF1P34228 PBP1YGR178C 2169 nt9.02□□□□□ -0.97
SEF1P34228 RTN2YDL204W 1182 nt9.01□□□□□ -0.97
SEF1P34228 FUN14YAL008W 597 nt9.01□□□□□ -0.97
SEF1P34228 BSP1YPR171W 1731 nt9.01□□□□□ -0.97
SEF1P34228 PRP4YPR178W 1398 nt9□□□□□ -0.97
SEF1P34228 CYT2YKL087C 675 nt9□□□□□ -0.97
SEF1P34228 BIO5YNR056C 1686 nt9□□□□□ -0.97
SEF1P34228 ARP6YLR085C 1317 nt9□□□□□ -0.97
SEF1P34228 RIB3YDR487C 627 nt8.99□□□□□ -0.97
SEF1P34228 PAU15YIR041W 375 nt8.99□□□□□ -0.97
SEF1P34228 UTH1YKR042W 1098 nt8.99□□□□□ -0.97
SEF1P34228 POM34YLR018C 900 nt8.99□□□□□ -0.97
SEF1P34228 YLR279WYLR279W 390 nt8.99□□□□□ -0.97
SEF1P34228 YML089CYML089C 369 nt8.99□□□□□ -0.97
SEF1P34228 HIP1YGR191W 1812 nt8.98□□□□□ -0.97
SEF1P34228 YGR012WYGR012W 1182 nt8.98□□□□□ -0.97
SEF1P34228 PEX2YJL210W 816 nt8.98□□□□□ -0.97
SEF1P34228 YKR005CYKR005C 1578 nt8.98□□□□□ -0.97
SEF1P34228 DPS1YLL018C 1674 nt8.97□□□□□ -0.97
SEF1P34228 MET2YNL277W 1461 nt8.97□□□□□ -0.97
SEF1P34228 YJL195CYJL195C 702 nt8.97□□□□□ -0.97
SEF1P34228 TSC10YBR265W 963 nt8.97□□□□□ -0.97
SEF1P34228 SSN3YPL042C 1668 nt8.95□□□□□ -0.98
SEF1P34228 YGR259CYGR259C 441 nt8.95□□□□□ -0.98
SEF1P34228 YAT1YAR035W 2064 nt8.95□□□□□ -0.98
SEF1P34228 PRO1YDR300C 1287 nt8.94□□□□□ -0.98
SEF1P34228 SNF1YDR477W 1902 nt8.92□□□□□ -0.98
SEF1P34228 NRT1YOR071C 1797 nt8.92□□□□□ -0.98
SEF1P34228 TIF6YPR016C 738 nt8.91□□□□□ -0.98
SEF1P34228 SFP1YLR403W 2052 nt8.91□□□□□ -0.98
SEF1P34228 ATG15YCR068W 1563 nt8.9□□□□□ -0.98
SEF1P34228 PLB1YMR008C 1995 nt8.9□□□□□ -0.98
SEF1P34228 ADH1YOL086C 1047 nt8.9□□□□□ -0.98
SEF1P34228 BMT6YLR063W 1098 nt8.89□□□□□ -0.99
SEF1P34228 GAP1YKR039W 1809 nt8.89□□□□□ -0.99
SEF1P34228 MET28YIR017C 564 nt8.87□□□□□ -0.99
SEF1P34228 GPN2YOR262W 1044 nt8.87□□□□□ -0.99
SEF1P34228 MSB4YOL112W 1479 nt8.84□□□□□ -0.99
SEF1P34228 ESS1YJR017C 513 nt8.84□□□□□ -0.99
SEF1P34228 NPP1YCR026C 2229 nt8.84□□□□□ -0.99
SEF1P34228 YEL008WYEL008W 381 nt8.83□□□□□ -1
SEF1P34228 YPI1YFR003C 468 nt8.82□□□□□ -1
SEF1P34228 CPD1YGR247W 720 nt8.81□□□□□ -1
SEF1P34228 IRC24YIR036C 792 nt8.81□□□□□ -1
SEF1P34228 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.81□□□□□ -1
SEF1P34228 GID7YCL039W 2238 nt8.79□□□□□ -1
SEF1P34228 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.79□□□□□ -1
SEF1P34228 FIT3YOR383C 615 nt8.79□□□□□ -1
SEF1P34228 DIF1YLR437C 402 nt8.78□□□□□ -1
SEF1P34228 UTR1YJR049C 1593 nt8.78□□□□□ -1
SEF1P34228 LOT5YKL183W 921 nt8.75□□□□□ -1.01
SEF1P34228 GND1YHR183W 1470 nt8.75□□□□□ -1.01
SEF1P34228 MAE1YKL029C 2010 nt8.74□□□□□ -1.01
SEF1P34228 YAR028WYAR028W 705 nt8.73□□□□□ -1.01
SEF1P34228 RIM8YGL045W 1629 nt8.72□□□□□ -1.01
SEF1P34228 SAM35YHR083W 990 nt8.71□□□□□ -1.02
SEF1P34228 PUP1YOR157C 786 nt8.71□□□□□ -1.02
SEF1P34228 PRM5YIL117C 957 nt8.69□□□□□ -1.02
SEF1P34228 SEN2YLR105C 1134 nt8.69□□□□□ -1.02
SEF1P34228 ZTA1YBR046C 1005 nt8.69□□□□□ -1.02
SEF1P34228 NAP1YKR048C 1254 nt8.68□□□□□ -1.02
SEF1P34228 ALP1YNL270C 1722 nt8.68□□□□□ -1.02
SEF1P34228 APT2YDR441C 546 nt8.67□□□□□ -1.02
SEF1P34228 MTG2YHR168W 1557 nt8.67□□□□□ -1.02
SEF1P34228 TPO4YOR273C 1980 nt8.67□□□□□ -1.02
SEF1P34228 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.66□□□□□ -1.02
SEF1P34228 AKR2YOR034C 2250 nt8.64□□□□□ -1.03
SEF1P34228 HMG2YLR450W 3138 nt8.64□□□□□ -1.03
SEF1P34228 ALD4YOR374W 1560 nt8.61□□□□□ -1.03
SEF1P34228 UGA4YDL210W 1716 nt8.61□□□□□ -1.03
SEF1P34228 SED1YDR077W 1017 nt8.61□□□□□ -1.03
SEF1P34228 SMM1YNR015W 1155 nt8.61□□□□□ -1.03
SEF1P34228 PGC1YPL206C 966 nt8.61□□□□□ -1.03
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