Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA3P32297 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHRNA3P32297 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA3P32297 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA3P32297 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA3P32297 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA3P32297 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA3P32297 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA3P32297 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA3P32297 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNA3P32297 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNA3P32297 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRNA3P32297 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA3P32297 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA3P32297 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA3P32297 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms