Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK6P29122 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK6P29122 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK6P29122 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK6P29122 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCSK6P29122 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCSK6P29122 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms