Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB9P28065 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMB9P28065 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB9P28065 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMB9P28065 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMB9P28065 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB9P28065 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB9P28065 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMB9P28065 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms