Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK2P24941 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK2P24941 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK2P24941 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK2P24941 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK2P24941 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK2P24941 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK2P24941 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK2P24941 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK2P24941 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK2P24941 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK2P24941 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK2P24941 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK2P24941 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK2P24941 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK2P24941 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK2P24941 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK2P24941 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK2P24941 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK2P24941 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK2P24941 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK2P24941 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK2P24941 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK2P24941 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK2P24941 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2P24941 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2P24941 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2P24941 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2P24941 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK2P24941 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK2P24941 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK2P24941 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK2P24941 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK2P24941 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK2P24941 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK2P24941 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK2P24941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK2P24941 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK2P24941 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK2P24941 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK2P24941 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK2P24941 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK2P24941 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK2P24941 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2P24941 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2P24941 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2P24941 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2P24941 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK2P24941 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK2P24941 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK2P24941 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK2P24941 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK2P24941 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK2P24941 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK2P24941 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK2P24941 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK2P24941 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK2P24941 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2P24941 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2P24941 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2P24941 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2P24941 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK2P24941 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK2P24941 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK2P24941 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK2P24941 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK2P24941 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK2P24941 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2P24941 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2P24941 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK2P24941 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK2P24941 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK2P24941 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK2P24941 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK2P24941 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK2P24941 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK2P24941 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK2P24941 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK2P24941 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK2P24941 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK2P24941 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK2P24941 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK2P24941 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK2P24941 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK2P24941 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK2P24941 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK2P24941 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK2P24941 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK2P24941 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK2P24941 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK2P24941 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK2P24941 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK2P24941 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK2P24941 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK2P24941 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK2P24941 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK2P24941 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK2P24941 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK2P24941 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK2P24941 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251 ms