Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP6V1C1P21283 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V1C1P21283 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6V1C1P21283 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V1C1P21283 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP6V1C1P21283 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP6V1C1P21283 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V1C1P21283 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms