Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BPBP20851 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4BPBP20851 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4BPBP20851 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C4BPBP20851 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4BPBP20851 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4BPBP20851 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C4BPBP20851 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4BPBP20851 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BPBP20851 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BPBP20851 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BPBP20851 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BPBP20851 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4BPBP20851 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4BPBP20851 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BPBP20851 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms