Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL2P19875 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL2P19875 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL2P19875 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL2P19875 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL2P19875 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL2P19875 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL2P19875 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL2P19875 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL2P19875 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL2P19875 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL2P19875 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL2P19875 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL2P19875 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL2P19875 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL2P19875 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL2P19875 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL2P19875 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms