Protein–RNA interactions for Protein: P16581

SELE, E-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELEP16581 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELEP16581 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELEP16581 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELEP16581 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELEP16581 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELEP16581 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELEP16581 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELEP16581 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SELEP16581 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELEP16581 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELEP16581 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELEP16581 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELEP16581 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELEP16581 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELEP16581 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELEP16581 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SELEP16581 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELEP16581 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELEP16581 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELEP16581 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELEP16581 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELEP16581 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELEP16581 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELEP16581 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELEP16581 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELEP16581 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SELEP16581 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELEP16581 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELEP16581 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELEP16581 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELEP16581 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELEP16581 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELEP16581 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELEP16581 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELEP16581 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELEP16581 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELEP16581 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELEP16581 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELEP16581 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELEP16581 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELEP16581 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELEP16581 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELEP16581 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELEP16581 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELEP16581 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELEP16581 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELEP16581 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SELEP16581 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SELEP16581 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELEP16581 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELEP16581 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELEP16581 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELEP16581 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELEP16581 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELEP16581 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELEP16581 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELEP16581 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELEP16581 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELEP16581 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELEP16581 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELEP16581 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELEP16581 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELEP16581 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELEP16581 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELEP16581 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELEP16581 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELEP16581 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELEP16581 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELEP16581 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELEP16581 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELEP16581 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELEP16581 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SELEP16581 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELEP16581 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELEP16581 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SELEP16581 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SELEP16581 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SELEP16581 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELEP16581 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELEP16581 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELEP16581 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELEP16581 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELEP16581 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELEP16581 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SELEP16581 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SELEP16581 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELEP16581 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELEP16581 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELEP16581 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELEP16581 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELEP16581 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELEP16581 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SELEP16581 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SELEP16581 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELEP16581 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SELEP16581 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SELEP16581 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SELEP16581 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELEP16581 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELEP16581 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms