Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSP16219 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSP16219 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSP16219 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSP16219 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACADSP16219 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSP16219 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSP16219 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSP16219 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACADSP16219 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACADSP16219 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACADSP16219 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACADSP16219 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACADSP16219 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACADSP16219 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSP16219 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSP16219 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACADSP16219 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSP16219 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSP16219 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSP16219 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSP16219 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSP16219 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACADSP16219 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACADSP16219 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACADSP16219 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACADSP16219 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACADSP16219 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACADSP16219 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACADSP16219 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACADSP16219 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACADSP16219 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACADSP16219 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACADSP16219 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACADSP16219 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACADSP16219 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACADSP16219 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSP16219 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSP16219 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSP16219 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACADSP16219 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACADSP16219 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACADSP16219 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACADSP16219 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACADSP16219 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSP16219 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACADSP16219 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACADSP16219 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACADSP16219 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACADSP16219 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACADSP16219 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACADSP16219 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACADSP16219 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACADSP16219 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSP16219 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACADSP16219 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSP16219 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSP16219 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSP16219 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSP16219 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSP16219 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACADSP16219 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACADSP16219 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSP16219 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSP16219 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSP16219 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACADSP16219 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACADSP16219 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACADSP16219 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACADSP16219 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACADSP16219 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACADSP16219 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADSP16219 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSP16219 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSP16219 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADSP16219 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACADSP16219 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSP16219 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSP16219 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSP16219 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSP16219 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSP16219 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSP16219 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSP16219 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSP16219 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSP16219 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADSP16219 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADSP16219 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADSP16219 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADSP16219 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACADSP16219 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACADSP16219 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSP16219 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADSP16219 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADSP16219 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSP16219 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSP16219 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSP16219 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADSP16219 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACADSP16219 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms