Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPNP16150 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPNP16150 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPNP16150 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPNP16150 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPNP16150 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPNP16150 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPNP16150 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPNP16150 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPNP16150 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPNP16150 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPNP16150 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPNP16150 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPNP16150 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPNP16150 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPNP16150 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPNP16150 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPNP16150 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPNP16150 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPNP16150 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPNP16150 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPNP16150 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPNP16150 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPNP16150 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPNP16150 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPNP16150 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPNP16150 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPNP16150 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPNP16150 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPNP16150 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPNP16150 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPNP16150 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPNP16150 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPNP16150 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPNP16150 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPNP16150 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPNP16150 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPNP16150 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPNP16150 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPNP16150 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPNP16150 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPNP16150 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPNP16150 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPNP16150 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPNP16150 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPNP16150 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPNP16150 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPNP16150 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPNP16150 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPNP16150 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPNP16150 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPNP16150 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPNP16150 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPNP16150 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPNP16150 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPNP16150 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPNP16150 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPNP16150 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPNP16150 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPNP16150 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPNP16150 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPNP16150 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPNP16150 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPNP16150 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPNP16150 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPNP16150 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPNP16150 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPNP16150 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPNP16150 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPNP16150 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPNP16150 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPNP16150 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPNP16150 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPNP16150 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPNP16150 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPNP16150 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPNP16150 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPNP16150 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPNP16150 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPNP16150 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPNP16150 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPNP16150 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPNP16150 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPNP16150 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPNP16150 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPNP16150 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPNP16150 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPNP16150 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPNP16150 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPNP16150 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPNP16150 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPNP16150 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPNP16150 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPNP16150 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPNP16150 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPNP16150 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPNP16150 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPNP16150 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPNP16150 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPNP16150 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms