Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPGDP15428 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPGDP15428 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPGDP15428 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HPGDP15428 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPGDP15428 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPGDP15428 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPGDP15428 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPGDP15428 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPGDP15428 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HPGDP15428 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPGDP15428 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPGDP15428 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPGDP15428 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPGDP15428 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPGDP15428 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPGDP15428 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPGDP15428 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPGDP15428 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPGDP15428 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPGDP15428 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPGDP15428 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPGDP15428 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPGDP15428 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPGDP15428 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPGDP15428 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPGDP15428 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPGDP15428 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPGDP15428 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPGDP15428 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPGDP15428 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPGDP15428 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPGDP15428 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPGDP15428 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPGDP15428 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPGDP15428 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HPGDP15428 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPGDP15428 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPGDP15428 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPGDP15428 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPGDP15428 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HPGDP15428 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPGDP15428 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPGDP15428 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPGDP15428 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPGDP15428 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPGDP15428 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPGDP15428 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPGDP15428 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPGDP15428 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPGDP15428 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPGDP15428 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPGDP15428 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPGDP15428 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPGDP15428 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPGDP15428 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPGDP15428 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPGDP15428 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPGDP15428 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPGDP15428 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPGDP15428 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPGDP15428 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HPGDP15428 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPGDP15428 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPGDP15428 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPGDP15428 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPGDP15428 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPGDP15428 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPGDP15428 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HPGDP15428 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPGDP15428 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPGDP15428 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPGDP15428 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPGDP15428 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPGDP15428 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPGDP15428 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPGDP15428 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPGDP15428 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPGDP15428 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPGDP15428 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPGDP15428 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPGDP15428 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPGDP15428 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPGDP15428 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPGDP15428 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HPGDP15428 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPGDP15428 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPGDP15428 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPGDP15428 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPGDP15428 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPGDP15428 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPGDP15428 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPGDP15428 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPGDP15428 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPGDP15428 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPGDP15428 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPGDP15428 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HPGDP15428 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPGDP15428 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPGDP15428 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms