Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VCANP13611 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VCANP13611 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VCANP13611 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VCANP13611 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCANP13611 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCANP13611 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCANP13611 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VCANP13611 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VCANP13611 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VCANP13611 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VCANP13611 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VCANP13611 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VCANP13611 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VCANP13611 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VCANP13611 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VCANP13611 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VCANP13611 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VCANP13611 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VCANP13611 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCANP13611 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCANP13611 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCANP13611 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCANP13611 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VCANP13611 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VCANP13611 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VCANP13611 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VCANP13611 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VCANP13611 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VCANP13611 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VCANP13611 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VCANP13611 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VCANP13611 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VCANP13611 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VCANP13611 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VCANP13611 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VCANP13611 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VCANP13611 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VCANP13611 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VCANP13611 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VCANP13611 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VCANP13611 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VCANP13611 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VCANP13611 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VCANP13611 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VCANP13611 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VCANP13611 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VCANP13611 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VCANP13611 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VCANP13611 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VCANP13611 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VCANP13611 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VCANP13611 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VCANP13611 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VCANP13611 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VCANP13611 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VCANP13611 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCANP13611 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VCANP13611 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VCANP13611 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VCANP13611 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCANP13611 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCANP13611 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCANP13611 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCANP13611 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VCANP13611 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCANP13611 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCANP13611 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCANP13611 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCANP13611 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCANP13611 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VCANP13611 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VCANP13611 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCANP13611 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VCANP13611 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VCANP13611 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VCANP13611 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VCANP13611 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCANP13611 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VCANP13611 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VCANP13611 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VCANP13611 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VCANP13611 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VCANP13611 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VCANP13611 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VCANP13611 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VCANP13611 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VCANP13611 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VCANP13611 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VCANP13611 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VCANP13611 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VCANP13611 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VCANP13611 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VCANP13611 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VCANP13611 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VCANP13611 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VCANP13611 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCANP13611 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCANP13611 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VCANP13611 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms