Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTSAP10619 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTSAP10619 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTSAP10619 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTSAP10619 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTSAP10619 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTSAP10619 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSAP10619 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTSAP10619 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSAP10619 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTSAP10619 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTSAP10619 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTSAP10619 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSAP10619 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSAP10619 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTSAP10619 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSAP10619 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSAP10619 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTSAP10619 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSAP10619 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSAP10619 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSAP10619 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSAP10619 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTSAP10619 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTSAP10619 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTSAP10619 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTSAP10619 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTSAP10619 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTSAP10619 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTSAP10619 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CTSAP10619 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTSAP10619 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTSAP10619 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTSAP10619 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTSAP10619 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTSAP10619 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTSAP10619 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTSAP10619 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTSAP10619 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTSAP10619 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTSAP10619 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTSAP10619 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSAP10619 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSAP10619 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSAP10619 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTSAP10619 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTSAP10619 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTSAP10619 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTSAP10619 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTSAP10619 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTSAP10619 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSAP10619 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSAP10619 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSAP10619 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSAP10619 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSAP10619 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTSAP10619 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTSAP10619 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSAP10619 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSAP10619 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSAP10619 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTSAP10619 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTSAP10619 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTSAP10619 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTSAP10619 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTSAP10619 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTSAP10619 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CTSAP10619 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTSAP10619 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTSAP10619 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSAP10619 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTSAP10619 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTSAP10619 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTSAP10619 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTSAP10619 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTSAP10619 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTSAP10619 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTSAP10619 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTSAP10619 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTSAP10619 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSAP10619 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSAP10619 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSAP10619 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSAP10619 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSAP10619 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSAP10619 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSAP10619 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTSAP10619 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTSAP10619 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTSAP10619 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSAP10619 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSAP10619 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSAP10619 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSAP10619 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSAP10619 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSAP10619 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSAP10619 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSAP10619 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSAP10619 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSAP10619 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms