Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GZMBP10144 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GZMBP10144 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GZMBP10144 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GZMBP10144 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GZMBP10144 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GZMBP10144 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GZMBP10144 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GZMBP10144 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GZMBP10144 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GZMBP10144 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GZMBP10144 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GZMBP10144 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GZMBP10144 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GZMBP10144 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GZMBP10144 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GZMBP10144 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GZMBP10144 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GZMBP10144 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GZMBP10144 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GZMBP10144 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GZMBP10144 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GZMBP10144 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GZMBP10144 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GZMBP10144 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GZMBP10144 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GZMBP10144 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GZMBP10144 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GZMBP10144 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GZMBP10144 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GZMBP10144 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GZMBP10144 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GZMBP10144 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GZMBP10144 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GZMBP10144 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GZMBP10144 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GZMBP10144 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GZMBP10144 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GZMBP10144 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GZMBP10144 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GZMBP10144 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GZMBP10144 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GZMBP10144 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GZMBP10144 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GZMBP10144 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GZMBP10144 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GZMBP10144 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GZMBP10144 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GZMBP10144 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GZMBP10144 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GZMBP10144 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GZMBP10144 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GZMBP10144 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GZMBP10144 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GZMBP10144 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GZMBP10144 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GZMBP10144 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GZMBP10144 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GZMBP10144 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GZMBP10144 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GZMBP10144 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GZMBP10144 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GZMBP10144 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GZMBP10144 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GZMBP10144 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GZMBP10144 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GZMBP10144 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GZMBP10144 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GZMBP10144 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GZMBP10144 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GZMBP10144 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GZMBP10144 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GZMBP10144 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GZMBP10144 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GZMBP10144 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GZMBP10144 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GZMBP10144 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GZMBP10144 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GZMBP10144 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GZMBP10144 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GZMBP10144 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GZMBP10144 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GZMBP10144 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GZMBP10144 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GZMBP10144 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GZMBP10144 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GZMBP10144 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GZMBP10144 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GZMBP10144 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GZMBP10144 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GZMBP10144 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GZMBP10144 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GZMBP10144 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GZMBP10144 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GZMBP10144 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GZMBP10144 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GZMBP10144 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GZMBP10144 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GZMBP10144 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GZMBP10144 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms