Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTMAP06454 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTMAP06454 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTMAP06454 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTMAP06454 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTMAP06454 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTMAP06454 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTMAP06454 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTMAP06454 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTMAP06454 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTMAP06454 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTMAP06454 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTMAP06454 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTMAP06454 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTMAP06454 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTMAP06454 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTMAP06454 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTMAP06454 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTMAP06454 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTMAP06454 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTMAP06454 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTMAP06454 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTMAP06454 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTMAP06454 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTMAP06454 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTMAP06454 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTMAP06454 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTMAP06454 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTMAP06454 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTMAP06454 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTMAP06454 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTMAP06454 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTMAP06454 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTMAP06454 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTMAP06454 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTMAP06454 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTMAP06454 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTMAP06454 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTMAP06454 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTMAP06454 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTMAP06454 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTMAP06454 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTMAP06454 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTMAP06454 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTMAP06454 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTMAP06454 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTMAP06454 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTMAP06454 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTMAP06454 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTMAP06454 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTMAP06454 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTMAP06454 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTMAP06454 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTMAP06454 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTMAP06454 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTMAP06454 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTMAP06454 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTMAP06454 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTMAP06454 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTMAP06454 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTMAP06454 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTMAP06454 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTMAP06454 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTMAP06454 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTMAP06454 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTMAP06454 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTMAP06454 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTMAP06454 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTMAP06454 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTMAP06454 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMAP06454 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMAP06454 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMAP06454 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTMAP06454 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTMAP06454 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTMAP06454 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTMAP06454 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTMAP06454 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTMAP06454 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTMAP06454 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTMAP06454 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTMAP06454 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTMAP06454 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTMAP06454 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTMAP06454 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTMAP06454 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTMAP06454 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTMAP06454 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTMAP06454 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTMAP06454 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTMAP06454 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTMAP06454 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTMAP06454 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTMAP06454 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTMAP06454 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PTMAP06454 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTMAP06454 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTMAP06454 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTMAP06454 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTMAP06454 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms