Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01737 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01737 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01737 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01737 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01737 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01737 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01737 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
P01737 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01737 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01737 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01737 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01737 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01737 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01737 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01737 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01737 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01737 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01737 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01737 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01737 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01737 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01737 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
P01737 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01737 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01737 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01737 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01737 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01737 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01737 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01737 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01737 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01737 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01737 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01737 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01737 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01737 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01737 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01737 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01737 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01737 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01737 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01737 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01737 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01737 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01737 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01737 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01737 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01737 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01737 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01737 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01737 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01737 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01737 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01737 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01737 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01737 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01737 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01737 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01737 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01737 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01737 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01737 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01737 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01737 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01737 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01737 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01737 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01737 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01737 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01737 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01737 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
P01737 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01737 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01737 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01737 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01737 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01737 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01737 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01737 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01737 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01737 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01737 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01737 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01737 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01737 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01737 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01737 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01737 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01737 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01737 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01737 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01737 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01737 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01737 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01737 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01737 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01737 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01737 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01737 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms