Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFDP00746 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFDP00746 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFDP00746 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFDP00746 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFDP00746 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFDP00746 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFDP00746 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFDP00746 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFDP00746 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFDP00746 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFDP00746 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFDP00746 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFDP00746 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFDP00746 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFDP00746 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFDP00746 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFDP00746 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFDP00746 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFDP00746 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFDP00746 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFDP00746 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFDP00746 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFDP00746 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFDP00746 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFDP00746 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFDP00746 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFDP00746 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFDP00746 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFDP00746 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFDP00746 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFDP00746 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFDP00746 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFDP00746 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFDP00746 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFDP00746 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFDP00746 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFDP00746 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFDP00746 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFDP00746 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFDP00746 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFDP00746 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFDP00746 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFDP00746 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFDP00746 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFDP00746 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFDP00746 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFDP00746 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFDP00746 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFDP00746 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFDP00746 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFDP00746 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFDP00746 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFDP00746 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFDP00746 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFDP00746 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFDP00746 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFDP00746 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFDP00746 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFDP00746 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFDP00746 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFDP00746 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFDP00746 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFDP00746 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFDP00746 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFDP00746 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFDP00746 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFDP00746 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFDP00746 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFDP00746 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFDP00746 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFDP00746 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFDP00746 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFDP00746 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFDP00746 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFDP00746 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFDP00746 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFDP00746 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFDP00746 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFDP00746 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFDP00746 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFDP00746 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFDP00746 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFDP00746 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFDP00746 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFDP00746 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFDP00746 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFDP00746 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFDP00746 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFDP00746 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFDP00746 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFDP00746 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFDP00746 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFDP00746 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFDP00746 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFDP00746 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFDP00746 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFDP00746 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFDP00746 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFDP00746 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms