Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGDSO95455 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGDSO95455 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGDSO95455 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGDSO95455 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGDSO95455 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGDSO95455 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGDSO95455 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGDSO95455 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGDSO95455 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGDSO95455 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGDSO95455 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGDSO95455 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGDSO95455 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGDSO95455 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGDSO95455 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGDSO95455 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGDSO95455 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGDSO95455 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TGDSO95455 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGDSO95455 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGDSO95455 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGDSO95455 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGDSO95455 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGDSO95455 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGDSO95455 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGDSO95455 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGDSO95455 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TGDSO95455 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TGDSO95455 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TGDSO95455 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGDSO95455 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGDSO95455 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGDSO95455 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGDSO95455 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGDSO95455 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TGDSO95455 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGDSO95455 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGDSO95455 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TGDSO95455 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TGDSO95455 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGDSO95455 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGDSO95455 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGDSO95455 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGDSO95455 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TGDSO95455 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGDSO95455 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGDSO95455 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGDSO95455 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGDSO95455 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGDSO95455 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGDSO95455 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGDSO95455 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGDSO95455 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGDSO95455 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGDSO95455 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGDSO95455 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGDSO95455 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGDSO95455 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGDSO95455 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGDSO95455 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGDSO95455 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGDSO95455 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGDSO95455 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGDSO95455 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGDSO95455 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGDSO95455 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGDSO95455 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGDSO95455 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGDSO95455 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGDSO95455 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGDSO95455 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGDSO95455 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGDSO95455 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGDSO95455 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGDSO95455 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGDSO95455 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGDSO95455 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TGDSO95455 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGDSO95455 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGDSO95455 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGDSO95455 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGDSO95455 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGDSO95455 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGDSO95455 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGDSO95455 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGDSO95455 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGDSO95455 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGDSO95455 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGDSO95455 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGDSO95455 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGDSO95455 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGDSO95455 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGDSO95455 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGDSO95455 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGDSO95455 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGDSO95455 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGDSO95455 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGDSO95455 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGDSO95455 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms