Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM20BO75063 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20BO75063 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20BO75063 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM20BO75063 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM20BO75063 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM20BO75063 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20BO75063 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20BO75063 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20BO75063 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms