Protein–RNA interactions for Protein: O60925

PFDN1, Prefoldin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN1O60925 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN1O60925 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PFDN1O60925 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PFDN1O60925 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN1O60925 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFDN1O60925 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PFDN1O60925 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN1O60925 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN1O60925 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFDN1O60925 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN1O60925 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PFDN1O60925 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms