Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC22O60826 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC22O60826 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC22O60826 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC22O60826 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC22O60826 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC22O60826 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC22O60826 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC22O60826 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC22O60826 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC22O60826 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC22O60826 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC22O60826 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC22O60826 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC22O60826 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC22O60826 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC22O60826 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC22O60826 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC22O60826 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC22O60826 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms