Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNAB3O43448 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNAB3O43448 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNAB3O43448 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNAB3O43448 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNAB3O43448 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNAB3O43448 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNAB3O43448 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms