Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX1O43435 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX1O43435 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX1O43435 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX1O43435 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX1O43435 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX1O43435 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX1O43435 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX1O43435 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX1O43435 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX1O43435 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX1O43435 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX1O43435 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX1O43435 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX1O43435 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX1O43435 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX1O43435 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX1O43435 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX1O43435 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX1O43435 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX1O43435 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX1O43435 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX1O43435 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX1O43435 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX1O43435 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX1O43435 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX1O43435 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX1O43435 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX1O43435 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX1O43435 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX1O43435 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX1O43435 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX1O43435 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX1O43435 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX1O43435 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX1O43435 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX1O43435 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX1O43435 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX1O43435 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX1O43435 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TBX1O43435 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TBX1O43435 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX1O43435 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX1O43435 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX1O43435 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX1O43435 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX1O43435 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX1O43435 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX1O43435 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBX1O43435 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX1O43435 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX1O43435 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX1O43435 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX1O43435 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX1O43435 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX1O43435 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBX1O43435 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBX1O43435 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBX1O43435 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBX1O43435 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBX1O43435 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX1O43435 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX1O43435 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX1O43435 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX1O43435 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX1O43435 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX1O43435 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX1O43435 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX1O43435 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX1O43435 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX1O43435 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX1O43435 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX1O43435 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX1O43435 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX1O43435 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX1O43435 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX1O43435 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX1O43435 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX1O43435 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX1O43435 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TBX1O43435 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX1O43435 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX1O43435 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX1O43435 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX1O43435 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX1O43435 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX1O43435 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX1O43435 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX1O43435 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX1O43435 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX1O43435 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX1O43435 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX1O43435 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX1O43435 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX1O43435 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX1O43435 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX1O43435 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX1O43435 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TBX1O43435 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX1O43435 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms