Protein–RNA interactions for Protein: O00159

MYO1C, Unconventional myosin-Ic, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1CO00159 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1CO00159 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1CO00159 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1CO00159 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1CO00159 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1CO00159 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1CO00159 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYO1CO00159 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYO1CO00159 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYO1CO00159 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYO1CO00159 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1CO00159 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1CO00159 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1CO00159 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1CO00159 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1CO00159 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYO1CO00159 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYO1CO00159 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYO1CO00159 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1CO00159 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYO1CO00159 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms