Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
J3QKU1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
J3QKU1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
J3QKU1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
J3QKU1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
J3QKU1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
J3QKU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
J3QKU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
J3QKU1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
J3QKU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3QKU1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3QKU1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
J3QKU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
J3QKU1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
J3QKU1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
J3QKU1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
J3QKU1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
J3QKU1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3QKU1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3QKU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3QKU1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3QKU1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3QKU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3QKU1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
J3QKU1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
J3QKU1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
J3QKU1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
J3QKU1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
J3QKU1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
J3QKU1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
J3QKU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
J3QKU1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
J3QKU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
J3QKU1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
J3QKU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
J3QKU1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
J3QKU1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
J3QKU1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
J3QKU1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
J3QKU1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
J3QKU1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
J3QKU1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
J3QKU1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
J3QKU1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
J3QKU1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
J3QKU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
J3QKU1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
J3QKU1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
J3QKU1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
J3QKU1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
J3QKU1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
J3QKU1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
J3QKU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
J3QKU1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
J3QKU1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
J3QKU1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
J3QKU1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
J3QKU1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3QKU1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3QKU1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3QKU1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3QKU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3QKU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
J3QKU1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
J3QKU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
J3QKU1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3QKU1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3QKU1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3QKU1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3QKU1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3QKU1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3QKU1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
J3QKU1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
J3QKU1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3QKU1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3QKU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3QKU1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
J3QKU1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3QKU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
J3QKU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
J3QKU1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3QKU1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
J3QKU1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
J3QKU1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
J3QKU1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
J3QKU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3QKU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3QKU1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
J3QKU1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3QKU1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
J3QKU1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
J3QKU1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
J3QKU1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
J3QKU1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
J3QKU1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
J3QKU1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
J3QKU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
J3QKU1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
J3QKU1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
J3QKU1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms