Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
FER1L4A9Z1Z3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
FER1L4A9Z1Z3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
FER1L4A9Z1Z3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
FER1L4A9Z1Z3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
FER1L4A9Z1Z3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
FER1L4A9Z1Z3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
FER1L4A9Z1Z3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
FER1L4A9Z1Z3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
FER1L4A9Z1Z3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
FER1L4A9Z1Z3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
FER1L4A9Z1Z3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
FER1L4A9Z1Z3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
FER1L4A9Z1Z3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
FER1L4A9Z1Z3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
FER1L4A9Z1Z3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
FER1L4A9Z1Z3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
FER1L4A9Z1Z3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FER1L4A9Z1Z3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.15■■■■■ 4.18
FER1L4A9Z1Z3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
FER1L4A9Z1Z3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
FER1L4A9Z1Z3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
FER1L4A9Z1Z3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
FER1L4A9Z1Z3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
FER1L4A9Z1Z3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
FER1L4A9Z1Z3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
FER1L4A9Z1Z3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
FER1L4A9Z1Z3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
FER1L4A9Z1Z3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
FER1L4A9Z1Z3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
FER1L4A9Z1Z3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
FER1L4A9Z1Z3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
FER1L4A9Z1Z3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
FER1L4A9Z1Z3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FER1L4A9Z1Z3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FER1L4A9Z1Z3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FER1L4A9Z1Z3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FER1L4A9Z1Z3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
FER1L4A9Z1Z3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
FER1L4A9Z1Z3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FER1L4A9Z1Z3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FER1L4A9Z1Z3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.83■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
FER1L4A9Z1Z3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
FER1L4A9Z1Z3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
FER1L4A9Z1Z3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
FER1L4A9Z1Z3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
FER1L4A9Z1Z3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms