Protein–RNA interactions for Protein: A6NIL9

CRYM-AS1, Putative uncharacterized protein CRYM-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYM-AS1A6NIL9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRYM-AS1A6NIL9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRYM-AS1A6NIL9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRYM-AS1A6NIL9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRYM-AS1A6NIL9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRYM-AS1A6NIL9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRYM-AS1A6NIL9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRYM-AS1A6NIL9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRYM-AS1A6NIL9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRYM-AS1A6NIL9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRYM-AS1A6NIL9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRYM-AS1A6NIL9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRYM-AS1A6NIL9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRYM-AS1A6NIL9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRYM-AS1A6NIL9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRYM-AS1A6NIL9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRYM-AS1A6NIL9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRYM-AS1A6NIL9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRYM-AS1A6NIL9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRYM-AS1A6NIL9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRYM-AS1A6NIL9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRYM-AS1A6NIL9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRYM-AS1A6NIL9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRYM-AS1A6NIL9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRYM-AS1A6NIL9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRYM-AS1A6NIL9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRYM-AS1A6NIL9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms