Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE3

EFCAB10, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB10A6NFE3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB10A6NFE3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFCAB10A6NFE3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFCAB10A6NFE3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFCAB10A6NFE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFCAB10A6NFE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB10A6NFE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB10A6NFE3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB10A6NFE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB10A6NFE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB10A6NFE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB10A6NFE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB10A6NFE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFCAB10A6NFE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB10A6NFE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFCAB10A6NFE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB10A6NFE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFCAB10A6NFE3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms