Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC008525.2-201ENST00000511000 82 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC245884.7-201ENST00000514037 356 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 HNRNPA1P62-201ENST00000559372 952 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.186-201ENST00000617234 362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TBATA-201ENST00000299290 1583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TBATA-203ENST00000456372 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 OLFML3-202ENST00000369551 1934 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ADAM32-203ENST00000437682 2281 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ZNF239-202ENST00000374446 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 KIR2DL4-201ENST00000345540 1447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CCNB3P1-201ENST00000504855 1431 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PAX6-258ENST00000639548 1417 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 FAM133B-203ENST00000438306 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RAB37-212ENST00000528438 1494 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LRTOMT-207ENST00000435085 3194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 STAT2-201ENST00000314128 3259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 FP885919.1-201ENST00000331259 1038 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 HOTAIRM1-202ENST00000428939 889 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ZNF548-209ENST00000598895 571 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC036214.2-201ENST00000606512 917 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 DHDDS-201ENST00000236342 1403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC008132.1-201ENST00000419447 2068 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC114760.2-201ENST00000606818 2065 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ELMOD3-205ENST00000409344 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 C3orf35-205ENST00000426078 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC009264.1-205ENST00000439694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MRGPRX1-201ENST00000302797 1190 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 KRTAP19-4-201ENST00000334058 310 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms