Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 KIAA0907-203ENST00000368321 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PABPC1P11-201ENST00000428966 2007 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC009159.4-201ENST00000624606 2031 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 C2orf88-201ENST00000340623 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CPT1B-207ENST00000457250 2217 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ANKUB1-202ENST00000462519 2222 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MUC13-205ENST00000616727 2879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MAEL-206ENST00000622874 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZNF226-202ENST00000337433 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SERHL2-202ENST00000335879 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC020917.3-201ENST00000621050 721 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CDH1-214ENST00000621016 3304 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RABEPK-203ENST00000373544 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MPP4-202ENST00000359962 2436 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL049775.1-201ENST00000380722 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LRTOMT-202ENST00000307198 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RNLS-202ENST00000371947 3385 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC024614.4-201ENST00000637454 2396 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LRRC2-201ENST00000296144 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RALYL-205ENST00000521268 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 KDM4E-201ENST00000450979 2339 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PSG6-209ENST00000601833 2321 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PKNOX2-201ENST00000298282 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 COX6B2-205ENST00000588572 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CRISPLD2-201ENST00000262424 4586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SIRPB2-201ENST00000359801 2642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CLDN4-202ENST00000431918 4108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MEF2C-213ENST00000508569 1882 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SLC12A3-202ENST00000438926 5567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 FUT6-202ENST00000318336 3137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PPAT-201ENST00000264220 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 WDR91-201ENST00000354475 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GNL3L-201ENST00000336470 2357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CAMK2G-201ENST00000305762 1820 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AP003559.1-201ENST00000540906 1831 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 KRT18P26-201ENST00000454475 1281 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MIR3183-201ENST00000578566 84 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TMED1-204ENST00000588289 541 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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