Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX13Q9Y5W8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms