Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REXO2Q9Y3B8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms