Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHKBQ9Y259 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms