Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A2Q9UPR5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms